Построение моделей диагностики глиом с помощью ИК-спектроскопии и оценивание их надежности
Keywords:
ИК-спектроскопия, глиомы головного мозга, статистическая обработка данных, классификацияAbstract
В статье представляется обзор данных по применению инфракрасной-Фурье-спектроскопии для диагностики глиом головного мозга. Описываются объекты исследования - оценки надежности модельных систем для изучения процесса неоплазии, с приведенными особенностями метода работы с каждым исследуемым биоптатом. Приводятся примеры построенных моделей классификации с помощью статистических методов обработки данных ИК-спектров.
References
Tsai HC, Baylin SB. Cancer epigenetics: linking basic biology to clinical medicine. Cell Res. 2011;21:502–517.
Солтан П. С. Клинико-генетическая характеристика глиальных опухолей у детей, Диссертация, Санкт-Петербург. 2019.
Louis D.N., Perry A., Reifenberger G. et al. The 20016 World Health Organization Classification of Tumors of the Central Nervous System: a summary // Acta Neuropathologica. – 2016. – Vol. 131. – P. 803–820.
Ostrom, Q.T. CBTRUS statistical report: primary brain and central nervous system tumors diagnosed in the United States in 2007-2011 / Q.T. Ostrom, Н. Gittleman, P. Liao [et al.] // Neuro Oncol. – 2014. –Vol. 16. – P. 1-63
Даценко В.И., Житов А.В., Умаров А.С. Метрология – основа научно-технического прогресса // Международный журнал прикладных и фундаментальных исследований. – 2015. – № 8-2. – С. 400-401
Rogers, L.R. Morphological magnetic resonance imaging features of therapyinduced cerebral necrosis / L.R. Rogers, J. Gutierrez, L. Scarpace [et al.] // J. Neurooncol. – 2011. – Vol. 101, № 1. – P. 25-32.
Павлов В.Н., Билялов А.Р., Гильманова Р.Ф., Якупов Р.Р., Ковтуненко А.C. Использование интеллектуальных методов обработки данных раман-спектроскопии для диагностики злокачественных опухолей // Медицинский вестник Башкортостана. 2018, c. 43-46
Steiner, G., Shaw, A., Choo-Smith, L.-P., Abuid, M. H., Schackert, G., Sobottka, S., … Mantsch, H. H. (2003). Distinguishing and grading human gliomas by IR spectroscopy. Biopolymers, 72(6), 464–471
Темлякова, Е. А., Камзолова, С. Г., Джелядин, Т. Р. и др. Применение метода PLS-DA для разделения промоторных и непромоторных последовательностей различных классов.
Cameron J. М., Ch Rinaldi Ch. , Butler H. J. , Hegarty M. G., Brennan P. M., Jenkinson M. D., Syed K. Stratifying Brain Tumour Histological Sub-Types: The Application of ATR-FTIR Serum Spectroscopy in Secondary Care // Cancers. 2000
Baker, M.J.; Trevisan, J.; Bassan, P.; Bhargava, R.; Butler, H.J.; Dorling, K.M.; Fielden, P.R.; Fogarty, S.W.; Fullwood, N.J.; Heys, K.A.; et al. Using Fourier transform IR spectroscopy to analyze biological materials. Nat. Protoc. 2014, 9, 1771–1791.
Krafft, C., Sobottka, S. B., Geiger, K. D. et al. Classification of malignant gliomas by infrared spectroscopy and linear discriminant analysis. Anal Bioanal Chem 387, 1669-1677 (2007).
Матинян, А. А. Распределение Хотеллинга и его применение / А. А. Матинян. // Исследования молодых ученых : материалы X Междунар. науч. конф. (г. Казань, май 2020 г.). — Казань : Молодой ученый, 2020. — С. 1-5.
Jermyn M., Desroches J., Aubertin K. et al. A review of FTIR spectroscopy advances with an emphasis on clinical translation challenges in oncology. Phys. Med. Biol., 2016, Vol. 61, № 23, P. 370-400.
Cameron, J.M.; Butler, H.J.; Smith, B.R.; Hegarty, M.G.; Jenkinson, M.D.; Syed, K.; Brennan, P.M.; Ashton, K.; Dawson, T.; Palmer, D.S.; et al. Developing infrared spectroscopic detection for stratifying brain tumour patients: Glioblastoma multiforme vs. lymphoma. Analyst 2019, 144, 6736–6750.